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莲藕主要由根、茎、叶、花、果实等几部分组成
一、根
莲藕的根有 2 种，一种是主根，另一种是不定根。主根是莲子播种后，由种子的胚根所形成的，但主根不发达。在生长过程中起作用的是不定根。不定根呈须状，成束地环生在地下茎节的四周。一般每个茎节上都有 6 束不定根，总数约有 130 ～ 180 条，每条根长约 8 ～ 14 厘米。在不定根上密生许多侧根。不定根能不断更新。幼根呈白色或淡紫色；老根呈黄褐色或深褐色。发达的不定根主要起吸收水分、养料和固定与支持植株等作用。
二、茎
莲藕的茎为地下茎，横生于土中，栽培时多用种藕作播种材料。种藕顶端有个顶芽、个叶芽和个较小的副芽，节上有鳞片和侧芽。栽植后，顶芽和侧芽均可萌发成细长的鞭状根茎，又称藕鞭或莲鞭。莲鞭有主鞭和侧鞭之分，主鞭由多节组成，每节长度不一，初生的短，后生的长。主鞭节部抽生分枝，即侧鞭，侧鞭节部还可以二次分生，每支种藕能生莲鞭十几条或更多，从而形成一个庞大的植株。
藕是由莲鞭先端膨大而形成的。主鞭先端几节形成的新藕，叫“主藕”、“亲藕”或“母藕”。主藕由 3～7 节构成或更多，因品种和环境条件的不同而有差异。藕最前一节较粗短，称为“藕头”藕头的前面（先端）有顶芽；最后一节细而长，称为“后把节”；中间各节较长而肥大，称为“藕身”，也称“中节”。在主藕的节间部分生的藕鞭膨大而形成的藕，称之为“子藕”，子藕一般 2～4 节，子藕的节数、大小与生长在主藕的部位有关，主藕先端的子藕小，节数也少，甚至只有节，愈向后部，子藕愈大，节数也愈多。子藕的节部分生的莲鞭膨大而形成的藕，称之为“孙藕”，“孙藕”较小，只有1～2 节，支主藕上着生子藕和孙藕齐全的藕，称之为“全藕”或“整藕”。
藕的皮色为白色或黄白色，其上多散生有淡褐色的皮点。藕中有细丝和孔道。细丝在藕折断后仍不断，所以有“藕断丝连”之说。孔道纵直多个，并与莲鞭、叶柄中的孔道相通，进而经荷叶中心的叶脐相接，进行气体交换。
三、叶
莲藕叶，又叫荷叶、藕叶、莲叶等。为盾形或圆形顶生单叶，全缘，中央稍凹陷。直径一般为 30～90 厘米。叶正面为绿色或蓝绿色，上有白色蜡粉，密生细毛，不沾水滴；叶背面为淡绿色或灰绿色，光滑无毛。叶背有叶脉 19～23 条，向叶缘呈放射状分布，叶片中央为叶脐，叶脉汇集于叶脐相接，叶柄内有气孔，与地下茎气孔相通，进行气体交换。不可将叶柄折断，否则雨水等从气孔灌入后容易使地下茎腐烂。
荷叶按其抽生先后种大小、形态的不同,又可分为钱叶 (水中叶) 、浮叶（漂叶）、立叶（站叶、莛叶）、后把叶（大架叶、后栋叶）和终止叶。种藕上的幼叶，在种藕形成时即已形成，其外有叶鞘保护，栽植以后，幼叶萌芽出鞘，长成小圆盘状的荷叶，叶柄短而细软，不能直立，沉入水中，称为“钱叶”。种藕顶芽抽生出莲鞭，莲鞭抽生荷叶。最初抽生的叶片较钱叶大，叶柄柔软，不能挺立而浮于水面，称为“浮叶”。随着植株的生长，再长出的叶片较为高大，叶柄长、粗、硬并带刺，高出水面，站立水中，称为“立叶”。到了夏、秋季节立叶渐次形成上升阶梯状叶群，上升到一定高度后，立叶又逐渐变短，形成下降阶梯状叶群。最后生出的片立叶最高大，其叶柄刺多而把叶锐利，叶面宽阔，称为“后把叶”。后把叶是开始结藕的标志。后把叶出现之后，在藕节上长出的最后片叶子为卷叶，叶片小而厚，叶色浓绿，叶柄短、细而光滑，称为“终止叶”。挖藕时，先找到后把叶和终止叶，两者连线所指的方向，便是藕的着生处。
四、花
莲藕的花，称荷花、莲花等。早熟品种一般少花。中、晚熟品种，在发育良好的主鞭上，从抽生第一花的鞭节开始至抽生后把叶的鞭节止，，或间隔数节抽生花。莲藕开花与否及多少，与品种及外界环境有关。种藕粗壮开花多，种藕小，节数少，即使为有花品种，有时也较少开花；天气高温、干旱各鞭节可连续开花开花多，水深、土温低开花少。花着生于花梗顶端。花梗与叶柄并生于同一节上，叶柄在前，花梗在后。花常单生，观赏品种有 2 朵并生的，称之为“并蒂莲”。花由花萼、花冠、雄蕊群、雌蕊群、花托及花梗 6 部分组成。花萼位于花被的外围；花冠由花瓣组成，花瓣的大小、形状、数量及颜色，因品种的不同而有差异，花瓣的颜色有白色、红色、淡红色等；雄蕊群环生于花托基部的四周，雄蕊由花丝、花药及附属物 3 部分组成；雌蕊柱头顶生，花柱极短，子房上位，心皮多数，散生，分别嵌在大花托内。荷花于清晨开放，下午闭合，开闭 3～4 天后调谢，花瓣散落，留下倒圆锥形的大花托，即“莲蓬”。
五、果实
莲蓬的果实统称“莲蓬”或“聚合果”。莲蓬内呈蜂窝状，一般有小孔 15～30 个，多时达 40 个以上，每孔含一坚果，坚果卵圆形或近圆形，坚果成熟后壳变坚硬，水分空气不易透入，所以落入水中也很难发芽，能长期保存能力，故有“千年不烂莲子”之说。坚果去壳后是薄而软的种皮，剥去种皮即为白色的莲肉，莲肉由两片肥厚的子叶组成中间夹生有绿色的胚芽，即“莲心”，将莲肉中的莲心剔去，即为通心莲子。
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